Elle couvre quelques 680 ans sous la tonsure des moines de Cîteaux. Ceux-ci créent le Clos de Vougeot, au début du XIIème siècle et veillent sur lui jusqu’à
Ce prieuré était celui des moines bénédictins de l’abbaye parisienne de Saint-Germain-des-Prés, maîtres de Gilly la paroisse voisine, présents ici dès le XIème siècle. L’expansion de l’abbaye de Cîteaux conduit à d’inévitables conflits avec Saint-Germain-des-Prés. Ce n’est qu’en 1499 que l’abbé de Cîteaux Jean de Cirey réussit, en vendant une partie de la vaisselle de l’abbaye, à se libérer d’une dette envers l’abbaye parisienne forcée d’accepter une terre proche de Melun en échange de l’abandon de ses droits à Gilly et Vougeot. Ainsi ce clos est-il lié à l’histoire de Saint-Germain-des-Prés à Paris !